培养目标：生物工程专业培养具备生命科学的基本理论和较系统的生物工程基本理论、基本知识和基本技能，掌握基础生物学、生理生化、分子生物学、遗传学及细胞生物学的基本理论和实验技能，掌握发酵工程、酶工程、动植物基因工程、细胞工程、动物胚胎工程等主干学科的基本理论和实验技术，掌握生物工程相关专业的一般知识，熟悉国家生物工程产业政策、知识产权及生物工程安全条例，了解国际生物工程发展的动态，能从事与生物工程相关的应用研究、技术开发、生产和行政管理等工作的创新性人才。
课程设置：普通化学、分析化学、有机化学、普通生物学、化工原理、生物化学、分子生物学、微生物学、免疫学、基因工程、发酵工程、蛋白质与酶工程、细胞工程、动物胚胎工程、微生物遗传育种、生物分离技术与工程设备、生物制剂等。
实践环节：细胞工程实验技术、蛋白质与酶工程实验技术、发酵工程实验技术、生物分离技术、基因工程实验技术、生化实验技术、微生物实验、细胞生物学实验、分子生物学实验技术等课程、以及科研训练及毕业论文、生物工程课程综合实习、同时在毕业实习环节安排学生到北京科研院所、生物工程公司、京郊等建立的实习基地进行实践学习，以此培养学生实践技能，全面提高学生综合素质。
