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在全国本科院校排名第761位，在新疆排第10名。
| 竞争力排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2017 | 761 | 昌吉学院 | 新疆 | 10 |
| 2016 | 737 | 昌吉学院 | 新疆 | 10 |
| 2015 | 777 | 昌吉学院 | 新疆 | 10 |
综合实力排名（校友会版）
昌吉学院2021在全国本科院校排名第451位，强于第465名的南昌师范学院，第465名的齐鲁师范学院，第465名的呼和浩特民族学院，第465名的四川民族学院，第465名的四川文理学院。在新疆排第10名，强于第11名的新疆政法学院，第12名的新疆理工学院，第13名的新疆科技学院。
| 校友会排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 451 | 昌吉学院 | 新疆 | 10 |
| 2020 | 461 | 昌吉学院 | 新疆 | 10 |
| 2019 | 625 | 昌吉学院 | 新疆 | 11 |
| 2018 | 590 | 昌吉学院 | 新疆 | 8 |
| 2017 | 598 | 昌吉学院 | 新疆 | 10 |
综合实力排名（软科版）
昌吉学院2021在全国本科院校排名第571位，强于第572名的琼台师范学院，第573名的鄂尔多斯应用技术学院，第574名的黑龙江工业学院，第575名的新疆政法学院，第576名的山西能源学院。在新疆排第10名，强于第11名的新疆政法学院。
| 软科排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 571 | 昌吉学院 | 新疆 | 10 |
| 2020 | 549 | 昌吉学院 | 新疆 | 10 |
