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赣南医学院2021在全国本科院校排名第661位，强于第662名的咸阳师范学院，第663名的兰州城市学院，第664名的攀枝花学院，第665名的红河学院，第666名的西藏藏医药大学。在江西排第20名，强于第21名的新余学院。
| 竞争力排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 661 | 赣南医学院 | 江西 | 20 |
| 2020 | 687 | 赣南医学院 | 江西 | 20 |
| 2019 | 714 | 赣南医学院 | 江西 | 20 |
| 2018 | 682 | 赣南医学院 | 江西 | 20 |
| 2017 | 731 | 赣南医学院 | 江西 | 21 |
综合实力排名（校友会版）
在全国本科院校排名第545位，在江西排第19名。
| 校友会排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2020 | 545 | 赣南医学院 | 江西 | 19 |
| 2019 | 584 | 赣南医学院 | 江西 | 17 |
| 2017 | 598 | 赣南医学院 | 江西 | 18 |
综合实力排名（软科版）
在全国本科院校排名第420位，在江西排第8名。
| 软科排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2018 | 420 | 赣南医学院 | 江西 | 8 |
| 2017 | 416 | 赣南医学院 | 江西 | 10 |
